Vaidlustuskomisjon teeb vaidlustuse sisulise lahendamise kohta otsuse 30 päeva jooksul puudusteta vaidlustuse laekumisest arvates.

Vaidlustuskomisjonil on erandlikult õigus teha otsus kümne tööpäeva jooksul eksperdiarvamuse, eelotsuse või rahandusministeeriumi järelevalvemenetluse alustamata jätmise või lõpetamise teatise saamisest arvates, kui vaidlustuskomisjon: