Mittetulundusühingutele (MTÜ) ja sihtasutustele (SA) kehtivad tulumaksuseaduse sätted sarnaselt teiste juriidiliste isikutega. Seaduses on kehtestatud mõned maksustamise erisused.
Erisoodustuste maksustamisel ei ole MTÜ-dele ega SA-dele sätestatud soodsamaid tingimusi. Maksustatakse samadel alustel teiste juriidiliste isikutega (vt